Dissertação

Establishing cellular models to investigate the role of LINE-1 elements in X-chromosome inactivation and genome stability EVALUATED

Os retrotransposões representam uma parte considerável do genoma do ratinho e, entre estes, os elementos LINE-1 têm mantido uma atividade elevada na linhagem de ratinho, bem como a capacidade de retrotransposição. Apesar de este fenómeno poder originar instabilidade genómica e doença, os elementos LINE-1 têm sido considerados importantes impulsionadores da evolução genómica e uma forma alternativa de controlar a expressão génica. No entanto, apesar da sua abundância e de evidência científica que aponta para a importância dos transposões em variados processos de regulação génica, estes elementos são frequentemente “ignorados” em estudos genómicos devido à sua natureza repetitiva no genoma. Neste projeto, foram estabelecidos modelos celulares para investigar o papel dos elementos LINE-1 no processo biológico de inativação do cromossoma X e na estabilidade genómica, durante a diferenciação celular e em células diferenciadas. Os sistemas de ativação e repressão de elementos LINE-1, que já tinham sido previamente estabelecidos em células estaminais embrionárias e em células progenitoras neurais, foram parcialmente otimizados. O sistema de ativação da expressão de elementos LINE-1 foi também implementado em fibroblastos (NIH- 3T3). Os resultados obtidos indicam que estes sistemas estão funcionais e permitem perturbar a expressão de elementos LINE-1, apesar de algumas melhorias futuras serem necessárias ao nível das células diferenciadas.
Transposões, LINE-1, CRISPR-Cas9, expressão génica, inativação do cromossoma X, estabilidade genómica.

novembro 30, 2021, 14:30

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Cláudia Alexandra Martins Lobato da Silva

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Associado

ORIENTADOR

Anne-Valerie Gendrel

Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes

Doutora