Dissertação

Genomic Characterization of Three Novel Acidovorax Phage Genera and Their Potential in Phage Biocontrol EVALUATED

O patógeno Acidovorax valerianellae provoca uma doença caracterizada por manchas pretas nos canónigos (Valerianella locusta), responsável por perdas consideráveis no rendimento em muitos países produtores, especialmente na Europa. Atualmente, nenhuma variedade resistente de V. locusta foi encontrada e não é possível controlar eficazmente esta doença. Além disso, a preocupação com o impacto ambiental dos pesticidas e desenvolvimento de resistência aos antibióticos tem obrigado a procura de novas abordagens para o controlo de doenças. Nesse sentido, o biocontrolo baseado em bacteriófagos tem surgido como uma estratégia alternativa sustentável. Neste estudo, os primeiros fagos a infetar A. valerianellae e A. cattleyae, Alfacinha1, Alfacinha3, Acica e Aval, foram isolados e caracterizados, sendo representativos de três novos géneros. Os fagos Aval e Acica revelaram características genómicas particulares de atividade lisogénica, codificando toxinas associadas a conversão lisogénica, em contraste com os fagos Alfacinha1 e Alfacinha3, que mostraram seguir um ciclo de vida lítico. Alfacinha3 foi selecionado para tratamento de sementes contra A. valerianellae, permitindo atingir uma redução de 87% na concentração bacteriana dentro da semente e aumentar a taxa de germinação de 58,9% para 93,3%. Além disso, após 22 dias de crescimento, as plantas infetadas apresentaram uma redução acentuada no índice de vigor, ao contrário daquelas tratadas com o fago cujo índice de vigor era semelhante ao controlo negativo, reduzindo, portanto, a progressão da doença. Este estudo mostra como a análise genómica representa uma ferramenta essencial para garantir a aplicação segura de fagos e demonstra o potencial do biocontrolo baseado em fagos contra A. valerianellae.
Acidovorax, Bacteriófagos, Biocontrolo, Canónigos, Análise genómica

novembro 12, 2021, 10:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Miguel Nobre Parreira Cacho Teixeira

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Associado

ORIENTADOR

Jeroen Wagemans

Laboratory of Gene Technology, KU Leuven

Research Manager