Dissertação

Exploration of ligands for the innate immune specific Zalpha domain EVALUATED

A função biológica do domínio de interação com Z-DNA/RNA (Zalpha) na proteína ADAR1p150 e os seus ligandos in vivo são desconhecidos. As proteínas da família das ADARs (adenosina deaminases que atuam em dsRNA) convertem adenosinas em inosinas (A-to-I editing). Esta reação enzimática leva à alteração dos pares de base nos transcritos editados, e por consequência a alterações nas proteínas traduzidas (por exemplo), pois a inosina é reconhecida como guanosina. Sabe-se que a expressão da ADAR1p150 é induzida por interferões e é essencial para prevenção de reações inflamatórias desreguladas, atuando como um controlo negativo, no entanto o papel do domínio Zalpha neste processo não é compreendido. Assim, o propósito deste trabalho, foi a determinação de possíveis ligandos endógenos do domínio Zalpha, através de EMSAs (Electrophoretic Mobility Shift Assays). Após determinação das condições ideais para tais interações, procedeu-se à cristalização do domínio Zalpha em complexo com os ligandos mais relevantes. Para estes estudos utilizaram-se oligonucleótidos que contêm inosina e são capazes de adotar uma conformação em Z (a estrutura Z DNA/RNA é reconhecida pelo domínio Zalpha), ou estruturas de RNA em gancho, RNA hairpins, cujo loop apresenta uma conformação semelhante à conformação em Z. Tendo em conta os promissores resultados obtidos ao longo deste trabalho, este pode ser considerando um passo relevante no caminho para a melhor compreensão do domino Zalpha e a respetiva função biológica, auxiliando na criação de novas terapias para doenças auto imunes associadas a este domínio.
ADAR1, Domínio Zalpha, Inosina, Z-DNA, Edição de RNA, RNA em gancho

Novembro 30, 2017, 11:0

Documentos da dissertação ainda não disponíveis publicamente

Orientação

ORIENTADOR

Alekos Athanasiadis

Instituto Gulbenkian da Ciência

Doutor

ORIENTADOR

Leonilde de Fátima Morais Moreira

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Auxiliar