Dissertação

Genome-wide profiling of alternative splicing in aging across human tissues: Tissue-specific aging signature and contribution of cellular senescence EVALUATED

Um dos maiores desafios actuais é manter saudável uma população cada vez mais idosa. O splicing alternativo (SA) – processo fortemente regulado, a partir do qual um gene origina várias proteínas – foi relacionado com o envelhecimento de humanos e ratinhos. Além de um maior número de genes sofrer SA com a idade, genes envolvidos em processamento de mRNA foram descritos como sofrendo alterações de expressão e de splicing com a idade, o que aponta para um papel importante do SA no envelhecimento. Neste trabalho foram analisados dados de sequenciação de RNA de tecidos de mais de 500 dadores saudáveis, obtidos pelo projecto Genotype-Tissue Expression, para recolha de assinaturas de SA. Estas apontam para alterações no SA de componentes do spliceosoma com a idade na maioria dos tecidos, excepto cérebro, onde são afectadas funções neurais. Usando modelos lineares baseados nas assinaturas de SA, a idade de biológica de cada tecido foi estimada e estes agrupados segundo tendências de envelhecimento. Tecidos de regiões do cérebro agruparam juntos, bem como os sistemas circulatório e respiratório. Outras análises sugeriram um aumento na heterogeneidade do SA na maioria dos tecidos, excepto colon, rim e glândula salivar, onde o SA diminui e dá lugar ao splicing constitutivo. Usando amostras de células progredindo para senescência replicativa, obteve-se uma assinatura de SA de senescência celular que foi utilizada para quantificar a contribuição deste processo para o envelhecimento. Estes resultados evidenciam a importância do SA no envelhecimento dos tecidos e ajudam a esclarecer os mecanismos de envelhecimento.
Envelhecimento, Senescência Celular, Splicing Alternativo, Transcriptómica, Biologia Computacional

Outubro 21, 2016, 11:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Nuno Luís Barbosa Morais

Instituto de Medicina Molecular - Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa

Doutor

ORIENTADOR

Nuno Gonçalo Pereira Mira

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Auxiliar