Dissertação
Addressing the relationship between Staphylococcus aureus abundance in the human skin microbiome and atopic dermatitis: a metagenomics approach EVALUATED
O aumento do interesse na relação entre o microbioma humano e doenças contribuiu ao desenvolvimento de técnicas de sequenciamento de baixo custo e softwares para a análise de metagenomas. Vários estudos revelaram uma relação entre a gravidade da doença Dermatite Atópica e a bactéria Staphylococcus aureus. Consequentemente, foi proposto, nesta tese, provar essa relação com base na análise metagenômica. Para investigar como a estrutura da comunidade microbiana muda em função da maior abundância de S. aureus no microbioma da pele, uma pesquisa in silico foi realizada em 183 amostras com vários graus de incidência de S. aureus. Com recurso à Análise de Coordenadas Principais (PCoA), revelaram-se semelhanças entre o microbioma das amostras de acordo com o valor percentual de S. aureus e o local de origem da amostra: antebraço, vincos antecubital e poplíteos. Em geral, foram reveladas dissimilaridades significativas entre os locais e entre amostras com diferentes percentagens de S. aureus. Os taxa microbianos mais responsivos ao aumento da abundância de S. aureus foram Propionibacterium acnes, Corynebacterium sp., Staphylococcus sp. e Staphylococcus succinus, independentemente da localização. Verificou-se a existência de uma correlação positiva entre as abundâncias de S. aureus e S. succninus em todas as amostras. Investigações genómicas determinaram que, embora estas espécies possuam vários genes em comum, existem diferenças significativas entre o número de genes envolvidos em virulência, doença e defesa. Isto sugere semelhante aptidão fisiológica, porém mecanismos de virulência distintos, adoptados por estas espécies no processo de colonização da pele.
novembro 28, 2018, 11:0
Publicação
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Orientação
ORIENTADOR
Isabel Maria De Sá Correia Leite de Almeida
Departamento de Bioengenharia (DBE)
Professor Catedrático