Dissertação
Designing novel tools to detect and quantify non-canonical DNA structures EVALUATED
No genoma, processos como a transcrição podem dar origem à formação de estruturas que diferem da estrutura canónica de cadeia dupla do DNA. Estas estruturas não-canónicas estão presentes por todo o genoma e apresentam diferentes funções como regulação génica, com a sua presença em promotores ativos, e na terminação da transcrição. Contudo, estas estruturas não-canónicas de DNA também apresentam perigo para a estabilidade do genoma se não forem bem reguladas, podendo originar instabilidade genómica e danos no DNA. Embora existam em todo o genoma humano, os métodos disponíveis atualmente não permitem a identificação e quantificação direta destas estruturas in vivo. No presente projeto, um novo método foi desenvolvido e caracterizado para observar estas estruturas em células vivas e fixadas. O método desenvolvido é uma construção de uma proteína que se sabe que identifica estas estruturas com uma proteína fluorescente. Os resultados obtidos indicam que este novo método identifica estas estruturas através da formação de focos em células vivas e fixadas e acumula-se em estruturas nucleares onde se sabe que as estruturas não-canónica de DNA se formam, como os telómeros e os nucléolos. Além disso, o novo método demonstra uma ligação dinâmica aos focos formados e alterações nos níveis destas estruturas não-canónicas de DNA podem ser observadas após tratamento com drogas em células vivas.
janeiro 15, 2021, 14:0
Documentos da dissertação ainda não disponíveis publicamente
Orientação
ORIENTADOR
Cláudia Alexandra Martins Lobato da Silva
Departamento de Bioengenharia (DBE)
Professor Associado