Dissertação

TERRA transcription profiles in human cancer cells EVALUATED

TERRA é um RNA longo não codificante transcrito a partir de telómeros eucariotas, um desencadeador importante do mecanismo Alternative Lengthening of Telomeres (ALT) independente de telomerase, utilizado por 15% dos cancros humanos para contrariar o encurtamento telomérico que ocorre com múltiplas divisões celulares. Várias linhas celulares ALT contêm níveis elevados de TERRA. Contudo, o conhecimento do perfil de transcrição de TERRA continua a ser limitado, tanto em relação aos níveis de transcrição de TERRA em diferentes linhas celulares, como às extremidades cromossómicas a partir das quais TERRA se origina. Através de sequenciação de TERRA em células ALT e telomerase-positivas, o laboratório Azzalin verificou que os níveis de TERRA transcrito pelas extremidades cromossómicas 7q e 12q aparentam estar especialmente elevados em células ALT, e levantou a hipótese que a quantificação de TERRA nestas extremidades poderia constituir uma ferramenta diagnóstica de cancros ALT. Os dados da sequenciação de TERRA foram validados através de RT-qPCR. Foi demonstrado que os níveis de TERRA são elevados em várias extremidades, particularmente 7q, 12q, 16p e 5p. TERRA destas extremidades foi quantificado em 10 a 20 moléculas por célula, um aumento médio de 5 a 10 vezes em relação a células telomerase-positivas. Consideramos que este aumento não é suficiente para estabelecer um limiar de TERRA 7q e 12q para discriminar células ALT. As extremidades 7q e 12q não contêm o promotor de TERRA rico em nucleótidos CpG previamente caracterizado. Logo, a segunda parte deste projeto consistiu em identificar, isolar e caracterizar um novo promotor putativo nestas extremidades.
TERRA, transcrição telomérica, Alternative Lengthening of Telomeres, RT-qPCR

Janeiro 18, 2021, 10:0

Documentos da dissertação ainda não disponíveis publicamente

Orientação

ORIENTADOR

Claus Maria Azzalin

Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes

Doutor

ORIENTADOR

Cláudia Alexandra Martins Lobato da Silva

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Associado