Dissertação

Computational analysis of isoform level regulation in T helper cells EVALUATED

Linfócitos T e B são os principais mediadores da imunidade adaptativa, responsável por uma resposta imunitária bastante eficiente contra agentes patogénicos. Os linfócitos B são responsáveis pela produção de anticorpos. Linfócitos T folliculares (células Tfh) têem um papel importante na produção de anticorpos através das interações com as células B no centro germinativo. Linfócitos T auxiliares (células Th) são outro tipo de Linfócitos T que atraem outras células imunitárias para o local de infecção e são classificados em Th1 ou Th2 de acordo com o tipo de resposta imunitária. Avanços na tecnologia de sequenciação de RNA permitiram a quantificação de transcriptos, enquanto que o aumento de poder computacional tornou possível uma análise dos transcritos diferencialmente usados (DTU) entre diferentes condições. Este tipo de análise permite a detecção de transcriptos diferencialmente expressos(DTE), mudança de isoformas e eventos de splicing alternativo. Nesta tese, foi realizada uma análise DTU de células Th e Tfh nos diferentes tipos de resposta imunitária. Foi observado que a presença de DTE e mudança de isoformas está igualmente distribuída e na mesma percentagem relativa em ambos os casos. 16\% dos genes que mostraram DTU foram também obtidos numa análise de genes diferencialmente expressos (DGE). Os transcritos obtidos estão envolvidos em mecanismos de regulação devido ao seu tipo de transcrito e diferenças na regiões não traduzidas (UTRs) dos transcriptos. Este trabalho permite concluir que existe um importante nível de regulação feito pela expressão diferencial de transcriptos que não é encontrada quando se analisa simplesmente a expressão génica.
células Tfh, células Th, Transcritos diferentemente usados, mudança de isoformas, splicing alternativo

Dezembro 2, 2019, 0:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Susana de Almeida Mendes Vinga Martins

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Associado

ORIENTADOR

Luís Ricardo Simões da Silva Graça

Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes

Professor Associado