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Dissertação

Computational analysis of isoform level regulation in T helper cells EVALUATED

Detalhes: Linfócitos T e B são os principais mediadores da imunidade adaptativa, responsável por uma resposta imunitária bastante eficiente contra agentes patogénicos. Os linfócitos B são responsáveis pela produção de anticorpos. Linfócitos T folliculares (células Tfh) têem um papel importante na produção de anticorpos através das interações com as células B no centro germinativo. Linfócitos T auxiliares (células Th) são outro tipo de Linfócitos T que atraem outras células imunitárias para o local de infecção e são classificados em Th1 ou Th2 de acordo com o tipo de resposta imunitária. Avanços na tecnologia de sequenciação de RNA permitiram a quantificação de transcriptos, enquanto que o aumento de poder computacional tornou possível uma análise dos transcritos diferencialmente usados (DTU) entre diferentes condições. Este tipo de análise permite a detecção de transcriptos diferencialmente expressos(DTE), mudança de isoformas e eventos de splicing alternativo. Nesta tese, foi realizada uma análise DTU de células Th e Tfh nos diferentes tipos de resposta imunitária. Foi observado que a presença de DTE e mudança de isoformas está igualmente distribuída e na mesma percentagem relativa em ambos os casos. 16\% dos genes que mostraram DTU foram também obtidos numa análise de genes diferencialmente expressos (DGE). Os transcritos obtidos estão envolvidos em mecanismos de regulação devido ao seu tipo de transcrito e diferenças na regiões não traduzidas (UTRs) dos transcriptos. Este trabalho permite concluir que existe um importante nível de regulação feito pela expressão diferencial de transcriptos que não é encontrada quando se analisa simplesmente a expressão génica.
Keywords: células Tfh, células Th, Transcritos diferentemente usados, mudança de isoformas, splicing alternativo

Discussão: dezembro 2, 2019, 0:0