Dissertação

SARS-CoV-2 infection testing by infrared spectroscopy and multivariate data analysis using a portable spectrometer EVALUATED

A disseminação da COVID-19 durante os últimos dois anos mudou drasticamente nossa vida diária, tornando-se o período mais instável enfrentado pela sociedade contemporânea. O alto contágio e razoável potencial de agravamento da doença tem colocado grande pressão nos sistemas globais de saúde. Portanto, o desenvolvimento de métodos de diagnóstico confiáveis e rápidos tornou-se imprescindível no controle da pandemia. O presente trabalho visa testar a capacidade de um método de diagnóstico para a presença de SARS-CoV-2 no sangue humano, com base em espectometria portátil FTIR-ATR e análise de dados multivariada (nomeadamente PCA e PLS-DA). Além disso, foi avaliada a capacidade do método em diferenciar amostras IgG positivas e IgG negativas e a repetibilidade da metodologia. O método demonstrou ser capaz de diferenciar amostras positivas e negativas para SARS-CoV-2, muito embora com valores consideráveis de RMSEC (0,34) e RMSECV (0,39). Blocos contíguos foi a metodologia de validação cruzada mais eficiente, fornecendo erros preditivos menores (RMSEP = 0,35) e reudizindo efeitos de overfitting no modelo. Considerando a capacidade de diferenciação entre amostras IgG positivas e IgG negativas, o modelo também apresenta consideráveis valores de RMSEC (0,38) e RMSECV (0,42), embora seja observado overfitting devido ao pequeno número de amostras disponíveis para validar / calibrar o modelo. FTIR-ATR mostrou-se um método altamente sensível a diferentes metodologias de tratamento das amostras de sangue analisadas. Conclui-se que a técnica mostra-se promissora e futuros estudos, elaborados com maior número de amostras e com técnicas de processamento padronizadas, devem ser realizados.
SARS-Cov-2, FTIR-ATR, quimiometria, diagnóstico de doenças, discriminação

novembro 17, 2021, 11:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

João Pedro Martins de Almeida Lopes

Faculdade de Farmácia da Universidade de Lisboa

Professor Auxiliar

ORIENTADOR

Ana Margarida Nunes da Mata Pires de Azevedo

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Auxiliar