Dissertação

Multiomics analysis of the aging mouse brain EVALUATED

O envelhecimento é um processo extremamente complicado que, até hoje, é pouco entendido. A percentagem de população envelhecida (>65 anos) tem vindo a aumentar drasticamente originando uma “pandemia”. Esta pandemia fez com que demência, uma doença muito comum com o envelhecimento, se tornasse na 7th maior causa de morte no mundo. O envelhecimento cerebral, tal como o envelhecimento, ainda é pouco percebido. A necessidade do seu estudo é imperativa e neste trabalho eu analisei 3 idades diferentes em ratos com o objetivo de melhorar o conhecimento científico desta área. Analises in silico tal como analise a expressão diferencial, analise de sobre-expressão, analise diferencial de enriquecimento dum conjunto de genes e analise de rede de co-expressão genética ponderada foram elaboradas para determinar como o transcriptoma se altera com a idade. Eu consegui determinar que, aos 6 meses de idade, o cérebro ainda está a acabar o desenvolvimento com uma grande impasse na produção de energia enquanto que aos 12 meses o cérebro já acabou o desenvolvimento e está a trabalhar em plena capacidade. Finalmente, aos 24 meses, o cérebro está envelhecido e inflamado cronicamente. Padrões transcriptomicos também foram identificados onde conjuntos de genes partilham padrões de transcrição semelhantes. Finalmente, eu tentei corrigir o “Batch effect” com sucesso limitado e é claro que estudos futuros têm de ser feitos para que se possa corrigir corretamente este efeito, permitindo a analises a grandes conjuntos de bases de dados relacionadas com o envelhecimento cerebral, tal como ao envelhecimento em si.
Envelhecimento cerebral, Transcriptoma, Genes, Termos de Ontologia genómica

outubro 25, 2023, 8:0

Documentos da dissertação ainda não disponíveis publicamente

Orientação

ORIENTADOR

Eugenio Francesco Fornasiero

Department of Neuro- and Sensory Physiology, University Medical Center, in Göttingen, Germany

Doutor

ORIENTADOR

Arsénio do Carmo Sales Mendes Fialho

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Catedrático