Dissertação
Upgrade of a Ustilaginomycetes's genome-scale metabolic model for MEL production by Moesziomyces antarcticus EVALUATED
Os biosurfactantes estão a ganhar atenção porque são obtidos biologicamente e podem substituir os surfactantes derivados de combustíveis fósseis. Um tipo importante de biosurfactante glicolipido é o Manosileritritolípidos (MEL), produzido principalmente por Ustilaginomycetes e Moesziomyces spp. A utilização otimizada do potencial metabólico destes organismos pode ajudar ao desenvolvimento biotecnológico, tornando a produção de MEL competitiva. Recorrendo ao uso de simulações in silico, foi possível obter previsões para situações experimentais. Uma vez que a rede metabólica de Moesziomyces não está codificada em nenhuma base de dados disponível, um modelo metabólico recente à escala do genoma para modelação da atividade metabólica de Ustilago maydis precisa de ser atualizado para utilização com estirpes de Moesziomyces, uma vez que estes produtores de MEL têm uma elevada semelhança genómica. A maioria dos problemas metabólicos encontrados no modelo estão relacionados com a produção de metabolitos específicos que não estão presentes no metabolismo de Moesziomyces e com a presença de reações incompletas. O software MATLAB e a toolbox COBRA foram utilizados para obter um modelo mais preciso. Fermentações com glucose como fonte de carbono, foram realizadas para testar o crescimento e a produção de MEL em M. antarcticus. Os valores obtidos foram dados como input ao modelo, que previu valores de erro superiores aos valores de erro obtidos com U. maydis, aplicando a abordagem do modelo baseado em restrições. Com mais dados experimentais e outras técnicas analíticas, este modelo atualizado permitirá várias aplicações biotecnológicas, como a investigação de respostas metabólicas a várias condições ambientais.
dezembro 7, 2022, 14:0
Publicação
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Orientação
ORIENTADOR
Departamento de Bioengenharia (DBE)
Professor Auxiliar Convidado