Automatic selection of monoclonal antibodies using Phage Display Technology EVALUATED

Detalhes: A combinação das Tecnologias de Phage Display com Next-Generation sequencig (NGS), é uma poderosa abordagem para a descoberta de anticorpos monoclonais (mAbs) específicos e de alta afinidade. Contudo, devido aos densos dados de NGS criados, a seleção de anticorpos torna-se num processo desafiante e propenso à subjetividade humana. Neste contexto, desenvolveram-se duas ferramentas bioinformáticas para a seleção automática de anticorpos, a partir de dados de NGS que advêm de Phage Display. O objetivo deste estudo foi validar as ferramentas desenvolvidas para a sua implementação no processo de descoberta de anticorpos. Os resultados mostraram que as ferramentas bioinformáticas selecionaram mais candidatos específicos, apesar de mais candidatos e projetos serem necessários testar para atingir significância estatística. Não obstante, os resultados são promissores, uma vez que as ferramentas têm vantagens adicionais, discutidas no presente estudo. Além disso, foi efetuada uma comparação entre a seleção de anticorpos por dados de NGS e por Classical ELISA screening acoplado à sequenciação de Sanger. Ambos os métodos foram eficazes na identificação dos clones mais enriquecidos, no entanto, a análise por NGS fornece acesso a uma maior diversidade de clones com resultados mais precisos e reprodutíveis, sendo ainda menos trabalhosa e demorada do que o Classical ELISA screening. O trabalho apresentado contribuiu para a implementação das ferramentas bioinformáticas no processo de descoberta de anticorpos com recurso a NGS, o que permitirá uma seleção mais precisa, menos tendenciosa e menos demorada, identificando ainda candidatos que possivelmente não seriam identificados através do método de Classical ELISA screening.

Discussão: dezembro 5, 2022, 0:0

Orientação

AUTOR

Marta Alexandra Filipe Alves (ist198574)

ORIENTADOR

André Filipe da Costa Faustino

iBET - Instituto de Biologia Experimental e Tecnológica

Doutor

ORIENTADOR

Arsénio do Carmo Sales Mendes Fialho

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Catedrático