PhD Theses

PhD in Biotechnology and Biosciences, Instituto Superior Técnico


Joana Rita Rodrigues Feliciano, “Towards the unveiling of the multifarious virulence mechanisms of the Burkholderia cepacia complex: exopolysaccharide biosynthesis, RNA chaperones, and development of an animal infection model”, 2017 (Supervisor: Jorge Leitão).

Sílvia Catarina Filipe Henriques, “Towards the Improvement of Tolerance to Acetic Acid and Formic Acids in Yeast: Identification of Candidate Genes and Engineering of the Haa1 Transcription Factor”, 2017 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Ana Sílvia Moreira "Chronic respiratory infections by Burkholderia cepacia complex bacteria in cystic fibrosis patients: epidemiology and variation of virulence, membrane lipid and metabolite profiles during long-term residence in the lungs", 2016 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Joana Filipa Fernandes Guerreiro, "Mechanistic insights into adaptation and tolerance to acetic acid in Saccharomyces cerevisiae and Zygosaccharomyces baillii", 2016 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

André Manuel Sardinha Grilo, "“Identification and characterization of small non-coding RNAs from bacteria of the Burkholderia cepacia complex", 2016 (Supervisor: Jorge Leitão)

Ana Catarina Portinha e Costa, "Antifungal drug resistance in the pathogenic yeast Candida glabrata: emphasis on the role of uncharacterized drug:H+ antiporters", 2014 (Supervisor: Miguel Cacho Teixeira)

Fátima Nunes Gil, Development of bioassays for pesticide toxicity assessment using the eukaryotic models Saccharomyces cerevisiae and Caenorhabditis elegans, 2014, PhD in Biotechnology (Supervisor: Cristina A Viegas, Co-supervisor: Jorge H Leitão)

Mário Rui Almeida dos Santos, "Sinorhyzobium meliloti outer membrane protein TolC and the transcriptional repressor EmrR are bacterial determinants of root-nodule symbiosis", 2014 (Supervisor: Leonilde Moreira; Co-supervisor: Jörg D Becker)

Nuno Bernardes, "Bacterial protein azurin as a new therapeutic tool to treat poor prognosis breast cancer with over-expression of P-cadherin", 2013 (Supervisor: Arsénio Fialho; Co-supervisor: Joana F Paredes)

Dalila Mil-Homens, "Burkholderia cenocepacia pathogenesis: unravelling the virulence funtions of trimeric autotransporter adhesins and development of alternative therapies to target this pathogen", 2012 (Supervisor: Arsénio Fialho)

Catarina Roma Rodrigues, "Global responses to phenol and myrcene in Pseudomonas at the level of cell membrane proteome unveiled by quantitative proteomics", 2012 (Supervisor: Isabel Sá-Correia; Co-supervisor: Pedro Miguel Santos)

Inês Silva, "Comparative genomics and transcriptomics to study mucoid morphotype variation in Burkholderia cepacia complex clinical isolates", 2012 (Supervisor: Leonilde M. Moreira; Co-supervisor: Jörg D. Becker)

Andreia Madeira,"Genome wide expression approaches applied to biomedical research: long-term adaptation Burkholderia cenocepacia to cystic fibroses patient's airways and extende ex-vivo cultivation of human mesenchymal stem cells", 2012 (Supervisor: Isabel Sá-Correia; Co-supervisor: Joaquim Sampaio Cabral)

Tânia R. Cabrito,"Characterization of multidrug resistance transporters in the model organisms Saccharomyces cerevisiaeand Arabidopsis thaliana: establishing a link between physiological role and action in chemical stress tolerance", 2011 (Supervisor: Isabel Sá-Correia; Co-supervisor: Miguel Cacho Teixeira)

Christian Ramos, "Roles played by Hfq-like RNA chaperones and sRNAs on the virulence of Burkholderia cepaciacomplex bacteria", 2011 (Supervisor: Jorge H. Leitão; Co-supervisor: Leonilde M. Moreira)

Artur B. Lourenço, "Yeast responses and determinants of resistance to propionic acid or ethanol at a systems level: chemogenomic and metabolomic strategies", 2011(Supervisor:Isabel Sá-Correia)

Paulo Jorge Moura Pinto da Costa Dias, "Yeast toxicogenomics focused on the agricultural fungicide mancozeb: involvement of the drug: H+ antiporter Flr1p", 2010 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Sandra Sofia Costa dos Santos, "Yeast as a model in pharmacogenomics: targets and mechanisms of resistance to imatinib and quinine", 2010 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Ana Sofia Ferreira, "Regulation and Biosynthesis of the Exopolysaccharide Cepacian by BurkholderiaStrains - Role in BiofilmFormation, Virulence and Adaptation to Stress Conditions", Instituto Superior Técnico, 2010 (Supervisor: Leonilde Moreira)

Ana Maria Cosme, "Functional analysis of the outer membrane protein TolC from Sinorhizobiummeliloti: role in protein secretion, polysaccharide biosynthesis and symbiosis", 2009 (Supervisor: Leonilde Moreira)

Karen Hoffmann, Biossíntese de gelano por Sphingomonas elodeaATCC 31461: os passos posteriores à formação da unidade repetitiva", PhD in Biotechnology, Instituto Superior Técnico, 2008 (Supervisor: Leonilde Moreira)

Nuno Gonçalo Pereira Mira, "Adaptation and resistance to weak acid food preservatives in Saccharomyces cerevisiae: the Haa1p- and the Rim101-signalling pathways", 2008 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Ana Teresa Fernandes Tavares Granja, "Gellan gum biosynthesis in Shingomonas elodeaand cytotoxicity studies of redox proteins", 2008 (Supervisor: Arsénio Mendes Fialho)

Sílvia Andreia Bento da Silva Sousa, " Burkholderia cepaciacomplex infections in cystic fibrosis patients: biosynthesis and role of the exopolysaccharide and investigation of other potential virulence factors"(Supervisor: JorgeHumberto Leitão)

Tânia Isabel Lopes Simões, "Respostas a stresse químico imposto por mancozebe e ácidos lipofílicos em Saccharomyces cerevisiae: abordagens gene a gene e proteómica", 2006 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Rita Maria Criner Y Dintel Matias Vargas, Yeast responses to quinidine: characterization of new drug: H+antiporters involved in quinidine resistance and identification of quinidine-responsive genes, 2005 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Mónica Sofia Vieira Cunha, O complexo Burkholderia cepaciaem infecções respiratórias de doentes portugueses com fibrose quística:epidemiologia molecular, resistência a antibióticos e presumíveis factores de virulência e persistência da infecção, 2004 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Miguel Nobre Parreira Cacho Teixeira, Molecular Responses to the Herbicide 2,4-Dichlorophenoxyacetic Acid (2,4) in Yeast: From a Gene by Gene Analysis to Global Approaches, 2004 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Maria de Guadalupe Gonçalves Cabral Lopes, "Avaliação da Toxicidade e Mecanismos de Adaptação a Herbicidas Clorofenoxiacéticos: A Levedura Saccharomyces cerevisiaeComo Modelo Experimental Eucariótico", 2004 (Supervisor: Cristina A. Viegas)

Maria Elisabete Sousa Silva, Estratégias para acelerar a descontaminação de solos poluídos com o herbicida atrazina: inoculação da bactéria mineralizadora de atrazina Pseudomonassp. ADP, bioestimulação por adição de citrato ou succinato e biossíntese e adição de emulsionantes, 2004 (Supervisor: Arsénio M. Fialho)

Ana Rita S. Marques, "Biossíntese e degradação de polissacáridos em Sphingomonas paucimobilisATCC 31461: clonagem dos genes ugpG, bgl1 e bgl3, e sua análise computacional e funcional", 2003 (Supervisor: Isabel Sá-Correia; co-supervisor: Arsénio M. Fialho)

Ilda Isabel T. Pereira, Biossíntese de peptidoglicano e alginato em Pseudomonas aeruginosa: análise funcional do gene glmM que codifica a fosfoglucosamina mutase, 2003 (Supervisor: Isabel Sá-Correia; co-supervisor: Jorge H.G. Leitão)

Paula A. Q. Videira, Biossíntese do exopolissacárido gelano em Sphingomonas paucimobilisATCC 31461: genes, enzimas e manipulação genética da via biossintética, 2002 (Supervisor: Isabel Sá-Correia; co-supervisor: Arsénio M. Fialho)

João A. Richau, Burkholderia cepacianas infecções respiratórias de doentes portugueses com fibrose quística: epidemiologia molecular e biossíntese de exopolissacárido, 2002 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Sandra I. N. Tenreiro, "Análise funcional de novos genes de Saccharomyces cerevisiaeque codificam presumíveis transportadores de múltiplas drogas da superfamília dos facilitadores maioritários", Doutoramento em Biotecnologia, Instituto Superior Técnico, 2001 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Alexandra Fernandes,A H+-ATPase da membrana plasmática e a resposta ao stress oxidativo, em particular ao stress pelo cobre, em Saccharomyces cerevisiae, 2000 (Supervisor: Isabel Sá-Correia)

Vanda C. Carmelo, Resposta fisiológica de Saccharomyces cerevisiaea stress ácido, criado por ácidos fortes ou fracos: papel da H+ATPase da membrana plasmática, 1998 (Supervisor: Isabel Sá-Correia).

Gabriel A.A. Monteiro,Mecanismos moleculares envolvidos na activação da H+-ATPase da membrana plasmática de Saccharomyces cerevisiaepelo etanol, 1998 (Supervisor: Isabel Sá-Correia).

Leonilde M. Moreira,Caracterização do genoma de estirpes dos géneros Thermuse Rhodothermus: polimorfismo dos macrofragmentos de restrição, do rDNA, e de megaplasmídeos, 1997 (Supervisor: Isabel Sá-Correia).

Jorge Humberto Gomes Leitão,Efeito de factores ambientais na via biossintética do alginato em Pseudomonas aeruginosa; dependência da transcrição de genes do alginato e da actividade de enzimas biossintéticas da fase do crescimento e das concentrações de O2e Cu2+, 1996 (Supervisor: Isabel Sá-Correia).

Arsénio M. Fialho, Contribuição para a análise genética da biossíntese do exopolissacárido gelano em Sphingomonas paucimobilis, 1996 (Supervisor: Isabel Sá-Correia).

Lígia Oliveira Martins,Via biossintética dos nucleótidos de açúcar envolvidos na produção do exopolissacárido gelano por Sphingomonas paucimobilis, 1994 (Supervisor: Isabel Sá-Correia).

Maria Fernanda Rosa, A H+-ATPase da membrana plasmática e os mecanismos de toxicidade e tolerância ao etanol em leveduras, 1993 (Supervisor: Isabel Sá-Correia).

Cristina A. Viegas, Regulação da actividade da H+-ATPase de membranas plasmáticas de Saccharomyces cerevisiaedurante o crescimento com ácido octanóico, 1993 (Supervisor: Isabel Sá-Correia).


PhD Thesis in Chemical and Biological Engineering, University of Minho

Luciano Francisco Borges Pereira, Bioethanol – Robust production strains for process intensification, 2015 (Advisor: Lucilia Domingues; Co-advisor: Isabel Sá-Correia)


PhD in Pharmaceutical Sciences-Analytical Chemistry, Faculty of Pharmacy-University of Porto

Carla P. Coutinho, Differentiation of clonal variants of the Burkholderia cepaciacomplex isolated during chronic respiratory infection in cystic fibrosis patients with FTIR spectroscopy, 2011(Supervisor: João A. Lopes; co-supervisor:Isabel Sá-Correia)

 

PhD in Biology(Microbiology), Science and Technology Faculty - Universidade Nova de Lisboa

Margarida Isabel Rosa Bento Palma, Sugar Transport in Yeast: Phylogenetic analysis of sugar porters and involvement in the global response to chemical stress, 2010 (Supervisor: Isabel Sá-Correia; co-supervisor: André Goffeau)