Tomorrow's lecture on the annotation of secondary metabolite gene clusters

3 Maio 2021, 23:43 Rodrigo Costa

Olá a todos, 


Lembro que amanhã exercitaremos a anotação de clusters de genes envolvidos na biossíntese de metabolitos secundários ("secondary metabolite biosynthetic gene clusters" - SM-BGCs). 


Reservem alguns ficheiros .fasta com a assemblagem (MetaSpades) dos vossos metagenomas, para que possam praticar algumas coisas em tempo real jcom os vossos dados. 


De certeza visitaremos este website: https://antismash.secondarymetabolites.org/#!/start


Consultem "antismash" e "BIG-SCAPE" na web para se familiarizarem com as ferramentas que utilizaremos na execução dos nossos projetos. Encontrarão os papers que descrevem estas ferramentas na nossa literatura. 


Obrigado e até amanhã :) 
Rodrigo