Sumários

Classificação de dados de expressão genética

25 maio 2016, 12:30 Ana Luísa Nobre Fred

Uso de scripts em Matlab para a classificação de dados de expressão genética usando diversos algoritmos: K-NN e Naive Bayes. Avaliação do efeito de seleção de genes (pro Correlação de Pearson) e de extração por PCA no desempenho dos classificadores no diagnóstico de dois tipos de cancro.


Classificação de dados de expressão genética

24 maio 2016, 15:30 Ana Luísa Nobre Fred

Uso de scripts em Matlab para a classificação de dados de expressão genética usando diversos algoritmos: K-NN e Naive Bayes. Avaliação do efeito de seleção de genes (pro Correlação de Pearson) e de extração por PCA no desempenho dos classificadores no diagnóstico de dois tipos de cancro.


Resolução de problemas

24 maio 2016, 09:00 Ana Luísa Nobre Fred

Resolução de problemas relacionados com a matéria de clustering, validação de clustering e classificação (supervisionada).


Análise exploratória de arrays de expressão genética com o programa Genesis

23 maio 2016, 08:00 Ana Luísa Nobre Fred

Aula de substituição. 

Introdução ao programa Genesis. Exploração de técnicas de clustering para agrupamento de dados de exploração genética, quer em termos de genes (avaliação de genes co-regulados) quer em termos de condições (tipos de cancro). 


Seleção de genes por Correlação de Pearson e avaliação dos mesmos com base em técnicas de clustering

20 maio 2016, 13:30 Ana Luísa Nobre Fred

Seleção de genes por técnicas de clustering e por seleção baseada na correlação de Pearson. Avaliação qualidade dos genes seleccionados com base na capacidade de separação de condições (tipos de cancro) por aplicação de técnicas de clustering sobre os dados de expressão genética correspondentes