Componente de Programação e Computação

Genómica Funcional e Bioinformática

Mestrado Bolonha em Engenharia Biológica

Minor em Tecnologias Biológicas

Componente de Programação e Computação

As aulas de laboratório serão exclusivamente computacionais. Uma parte da UC foca-se na utilização de aplicações computacionais pré-existentes, enquanto que um terço se centra no desenvolvimento de novas ferramentas, desenvolvendo capacidades de programação. Especificamente, utilizar-se-ão as seguintes plataformas: 1. Anotação e comparação de genomas – CLC Genomics Workbench 2. Previsão de estrutura de proteínas – VAST; EXPRESSO 3. Análise quantitativa de geis bidimensionais – SameSpots. 4. Interpretação do significado biológico de dados à escala do genoma – GoToolBox; Kegg Mapper; Yeastract; STRING 5. Análise de dados de metabolómica baseada em NMR - Metaboanalyst 6. Modelação de redes metabólicas – COPASI 7. Clustering de dados – Genesis; MATLAB 8. Classificação de dados – MATLAB 9. Bioestatística - MATLAB