LAB#2 - Sequence Alignment (I)

30 setembro 2014, 09:30 • Sara Madeira

LAB#2 - Sequence Alignment (I)

29 setembro 2014, 14:00 • Sara Madeira

Global alignment, local alignment and multiple alignment: exercises.

Pairwise Sequence Alignment (III) & Multiple Sequence Alignment (I)

29 setembro 2014, 12:30 • Sara Madeira

Heuristic pairwise alignment: BLAST and FASTA.

Multiple Sequence Alignment: problem definition.

Greedy approach for multiple sequence alignment and CLUSTALW.

LAB#1 - Introduction to Gene Bank

23 setembro 2014, 17:00 • Sara Madeira

Exploratory lab on the use of Gene Bank.

NOTA: Aula não leccionada devido a uma confusão com os horários. Será dado apoio aos alunos nos horários de atendimento e em horários a marcar entre estes e o docente.

Pairwise Sequence Alignment (II)

23 setembro 2014, 12:30 • Sara Madeira

Dynamic Programming (DP).

Needleman-Wunsch DP algorithm for global alignment.

Smith-Waterman DP algorithm for local alignment.