Dissertação

{pt_PT=Desenvolvimento de um Ambiente para Anotação de Dados em Bioengenharia} {} EVALUATED

{pt=Nas ciências biológicas, é cada vez mais comum a existência de metodologias que produzem grande volume de dados. Para fazer sentido destes dados, bem como permitir a sua procura, exploração e reutilização, é necessário que o contexto e proveniência dos dados sejam descritos, sob a forma de metadados. Estes metadados normalmente são expressos através de anotações, que são uma forma estandardizada e semanticamente rica de os expressar, e sempre estruturadas como ontologias. A morosidade deste processo, na procura da ontologia mais adequada para a anotação de determinado dado e na identificação do conceito pretendido dentro dessa ontologia é um problema premente pelo que é crítico que haja suporte informático para o facilitar. O objetivo é o desenvolvimento de uma infraestrutura de suporte a este tipo de tarefas, tomando como referência os repositórios de dados BioPortal, AgroPortal e GeoNames e outras ferramentas já desenvolvidas como o OntoMaton, um add-on para google spreadsheets e o AgreementMakerLight (AML), um mapeador de ontologias leve. A solução proposta consiste no desenho, desenvolvimento e validação de um ambiente web que suporte as tarefas de anotação de dados de forma mais automatizada em tempo e eficiência., en=In the biological sciences, it is increasingly common to have methodologies that produce large amounts of data. In order to make sense of these data, as well as to enable them to be searched, exploited and reused, the context and provenance of the data must be described in the form of metadata. These metadata are usually expressed through annotations, which are a standardized and semantically rich way of expressing them, and always structured as ontologies. The slowness of this process, in the search for the most appropriate ontology for the annotation of a given data and in the identification of the intended concept within this ontology is a pressing problem so it is critical that there is an informatic support to facilitate this process. The objective is the development of an infrastructure to support this type of tasks taking as reference the data repositories BioPortal, AgroPortal and GeoNames and other tools already developed such as OntoMaton, an add-on to google spreadsheets and the Agreement Maker Light (AML), a light ontologies mapper. The solution consists of the design, development and validation of a web environment which supports the data annotation tasks as automated as possible in time and efficiency.}
{pt=Ambiente para anotação de dados, Biologia, Bio-engenharia, BioPortal, AgroPortal, Geonames., en=Environment for data annotation, Biology, Bioengineering, BioPortal, AgroPortal, Geonames.}

Novembro 9, 2017, 10:30

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

José Luís Brinquete Borbinha

Departamento de Engenharia Informática (DEI)

Professor Associado

ORIENTADOR

Daniel Pedro de Jesus Faria

Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras

Investigador Principal