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Dissertação

Effect of alterations in non-coding regions in genomic expression reprogramming of two Candida glabrata clinical isolates EVALUATED

Detalhes: Recentemente, a maioria das análises genómicas em isolados clínicos de C. glabrata focaram as modificações nas regiões codificantes, ignorando o genoma não-codificante. Neste trabalho, os genomas não-codificantes de uma estirpe de referência, CBS138, e de um isolado clínico, FFUL887, foram comparados. Entre outras características fenotípicas, estas estirpes são diferentemente resistentes a antifúngicos, sendo que o isolado FFUL887 é mais tolerante a fluconazole, voriconazole e caspofungina do que a CBS138. Alterações massivas têm sido identificadas no genoma não-codificante das duas estirpes, reflectindo a elevada plasticidade que caracteriza estas regiões. Tem sido posto ênfase na examinação de como estas alterações podem causar impacto na governação da regulação da expressão genética geral nas duas estirpes por modulação da interação entre factores de transcrição e os seus locais de ligação. Em particular, a rede regulatória controlada pelo CgPdr1, um regulador chave na resistência a antifúngicos em C. glabrata, foi estudada em detalhe. 31 Novos alvos putativos do CgPdr1 cujo promotor albergue pelo menos um local de ligação para o CgPdr1 na FFUL887 e que estivesse ausente no promotor da CBS138, foram identificados. 7 Destes alvos putativos do CgPdr1 foram confirmados na atribuição de máxima tolerância à caspofungina e 2 foram identificados como necessários para a tolerância ao fluconazole. Os resultados obtidos neste estudo são esperados que contribuam para o avanço da percepção dos mecanismos subjacentes à evolução das redes regulatórias que controlaram a expressão genómica de células de C. glabrata durante a colonização no hospedeiro humano e durante a aquisição de resistência a antifúngicos.
Keywords: C. glabrata, resistência, antifúngicos, regiões não-codificantes, evolução da rede regulatória

Discussão: dezembro 14, 2015, 15:30