Genomic Characterization of Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis Associated with Respiratory Tract Infections EVALUATED

Detalhes: Infecções humanas por Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis (SDSE) têm aumentado nas últimas décadas. Tipagem do gene emm, que codifica um factor de virulência importante em SDSE, revelou dois tipos emm com associação quase exclusiva a infecções do tracto respiratório em Portugal. Esta descoberta motivou a caracterização genómica de 199 estirpes provenientes de infecções do tracto respiratório em Portugal durante os anos 2011 a 2019 para definir as principais linhagens clonais responsáveis por infecção do tracto respiratório, para determinar os perfis de resistência a agentes antimicrobianos, e empregar sequenciação de alto débito para determinar os tipos emm, perfis de multilocus sequence typing (MLST) e core genome MLST (cgMLST), para identificar factores de virulência conhecidos, e um estudo de associação genética para explorar factores de virulência que possam ser responsáveis por tropismo para o tracto respiratório. A tipagem do gene emm revelou 31 sequence types (ST) distintos, dos quais stc36 e stC839 estavam quase exclusivamente associados a infecções respiratórias. A MLST revelou 121 STs distribuídos por 37 complexos clonais (CC) e por 72 singletons. Três CCs, CC3, CC49 e CC68 estavam quase exclusivamente associados a infecção respiratória. Enquanto alguns CCs possuíam vários tipos emm, os CCs associados ao tracto respiratório estavam associados aos tipos emm stC36 e stC839. Entre os factores de virulência conhecidos, o gene mf3 estava quase exclusivamente associado aos CCs do tracto respiratório. O estudo de associação genética mostrou que as estirpes destes CCs não possuíam várias proteínas do sistema CRISPR/Cas, cujo papel é importante na protecção contra fagos.

Discussão: dezembro 2, 2022, 16:30

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

AUTOR

Filipe Barbosa Valcovo (ist198889)

ORIENTADOR

Marcos Daniel Caetano Borges de Pinho

Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa

Doutor

ORIENTADOR

Leonilde de Fátima Morais Moreira

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Associado