Dissertação
Tackling the diversity of the marine microbial rare biosphere: methodological challenges and ecological insights EVALUATED
A biosfera rara microbiana representa a maior parte da diversidade microbiana em todos os ambientes. Isso é historicamente reconhecido na biologia geral e confirmado na microbiologia pelo surgimento da sequenciação em massa do gene da subunidade pequena do ribossoma. O número de estudos sobre a biosfera rara microbiana vem crescendo a cada ano, reconhecendo-se que, apesar de sua baixa abundância, contribui para o funcionamento do ecossistema e é importante para entender a as comunidades microbianas. Até hoje não existe uma definição coerente de raridade microbiana e as utilizadas na literatura são variadas e sem significado biológico. Para resolver isso, o algoritmo de Análise Multivariada de Limites foi proposto recentemente. Este trabalho testou esse algoritmo, constatando que fornece resultados coerentes quando comparando dados de diferentes amostragens do ambiente marinho, mas não fornece uma definição não subjetiva da biosfera rara microbiana. Usando as comunidades procarióticas raras descritas com esse método, foi possível explorar como diferentes estratégias de metagenómica e metodologias de amostragem de água do mar influenciam a descrição da biosfera rara procariota marinha. Informações ecológicas dos dados do oceano Ártico e dos dados do microbioma de Spongia officinalis (esponja marinha), permitiram corroborar o conhecimento existente sobre os processos de formação de comunidades procarióticas raras marinhas. Além disso, este trabalho sugere como integrar mecanismos estocásticos e determinísticos na estruturação das comunidades procarióticas raras no ambiente marinho, com massas de água e simbiose desempenhando papéis-chave. Finalmente, este trabalho fornece sugestões metodológicas para a amostragem da biosfera rara procariótica na água do mar.
novembro 26, 2019, 14:30
Publicação
Obra sujeita a Direitos de Autor
Orientação
ORIENTADOR
Catarina Maria Pinto Mora Pinto de Magalhães
Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha, Universidade do Porto, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto
Professor Auxiliar Convidado