Disciplina Curricular
Taxonomia Microbiana TMicr
Mestrado Bolonha em Microbiologia - MB2013
Peso
6.0 (para cálculo da média)
Objectivos
O principal objectivo deste curso é fornecer aos estudantes um conhecimento teórico sólido acerca dos princípios gerais e métodos utilizados em taxonomia microbiana (em particular de procariotas), encarada nas suas vertentes de classificação, identificação, diferenciação e nomenclatura, complementado por uma aplicação laboratorial de alguns dos principais métodos de diferenciação/classificação e identificação/diagnóstico utilizados actualmente em taxonomia bacteriana. Constituem objectivos adicionais a discussão da aplicabilidade dos conceitos e métodos em termos de taxonomia microbiana sensu lato e em termos de situações de ambiente real.
Programa
Curso teórico Introdução à Taxonomia. Conceitos básicos. Abordagens e evolução da taxonomia bacteriana. O conceito de espécie em microbiologia. Interacções e utilidade da taxonomia. Taxonomia Numérica. Princípios básicos. Métodos hierárquicos e não hierárquicos em taxonomia. Quimiotaxonomia. Princípios básicos e metodologias. Métodos analíticos de fingerprinting. Taxonomia Molecular. Princípios básicos. Filogenias. Marcadores filogenéticos e filogenias de genomas completos. Diversidade fenotípica e filogenias. Nomenclatura: princípios e regras básicas. Identificação e diagnóstico: abordagens fenotípicas e moleculares. Diferenciação e tipificação: métodos fenotípicos e moleculares. Epidemiologia e rastreabilidade. Abordagem polifásica. Curso prático Análise de dados em taxonomia numérica: os programas NTSYS-PC (Exeter) e BioNumerics (Applied Maths). Aplicação de métodos quimiotaxonómicos e moleculares de identificação e diferenciação de microrganismos seleccionados.
Metodologia de avaliação
Aulas teóricas e práticas laboratoriais. O estudante pode optar por um de dois modelos de avaliação: (i) exame final escrito a realizar na época de exames (2 datas de exame); ou (ii) realização teste escrito, a realizar nas datas indicadas no início do semestre. Cada frequência corresponde a 50% da nota final. Os estudantes que optarem pelo sistema de frequências apenas poderão apresentar-se à 2ª data de exame, para efeitos de recurso ou melhoria. Aprovação com classificação ≥ 9,5 (0-20).