Dissertação

Desenvolvimento de um Ambiente para Anotação de Dados em Bioengenharia EVALUATED

Nas ciências biológicas, é cada vez mais comum a existência de metodologias que produzem grande volume de dados. Para fazer sentido destes dados, bem como permitir a sua procura, exploração e reutilização, é necessário que o contexto e proveniência dos dados sejam descritos, sob a forma de metadados. Estes metadados normalmente são expressos através de anotações, que são uma forma estandardizada e semanticamente rica de os expressar, e sempre estruturadas como ontologias. A morosidade deste processo, na procura da ontologia mais adequada para a anotação de determinado dado e na identificação do conceito pretendido dentro dessa ontologia é um problema premente pelo que é crítico que haja suporte informático para o facilitar. O objetivo é o desenvolvimento de uma infraestrutura de suporte a este tipo de tarefas, tomando como referência os repositórios de dados BioPortal, AgroPortal e GeoNames e outras ferramentas já desenvolvidas como o OntoMaton, um add-on para google spreadsheets e o AgreementMakerLight (AML), um mapeador de ontologias leve. A solução proposta consiste no desenho, desenvolvimento e validação de um ambiente web que suporte as tarefas de anotação de dados de forma mais automatizada em tempo e eficiência.
Ambiente para anotação de dados, Biologia, Bio-engenharia, BioPortal, AgroPortal, Geonames.

Novembro 9, 2017, 10:30

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

José Luís Brinquete Borbinha

Departamento de Engenharia Informática (DEI)

Professor Associado

ORIENTADOR

Daniel Pedro de Jesus Faria

Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras

Investigador Principal