Dissertação

Escherichia Coli simulation using the Dynamic Energy Budget theory applied on a multi-agent environment EVALUATED

A Escherichia Coli é uma bactéria tubular gram-negativa, e um dos microorganismos mais antigos que mantém uma relação simbiótica com o ser humano. É frequentemente utilizada na investigação, tornando-se, como tal, numa referência em estudos de microbiologia. Neste trabalho são apresentados os resultados de uma simulação multi-agentes da E. Coli utilizando a teoria Dynamic Energy Budget, com o objectivo de reproduzir os seus padrões de movimentação e comportamentos do seu ciclo de vida. O trabalho também inclui a implementação de um conjunto de mutações baseadas na alteração de parâmetros DEB. A Framework ION foi utilizada como ferramenta de desenvolvimento para gerar o ambiente bacteriano e os protocolos de interacção com os agentes. O objectivo desta implementação é testar a possibilidade de utilizar a teoria DEB aplicada a um cenário multi-agente para obter resultados realistas, comparáveis com investigação experimental anteriormente publicada.
Escherichia Coli, Simulação multi-agente, Framework ION, Teoria Dynamic Energy Budget, Ciclo de vida bacteriano, Chemotaxis bacteriana, Comportamento emergente, Mutações, Estirpes

Novembro 4, 2011, 14:30

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

CO-ORIENTADOR

Carlos António Roque Martinho

Departamento de Engenharia Informática (DEI)

Professor Auxiliar

ORIENTADOR

Pedro Alexandre Simões dos Santos

Departamento de Matemática (DM)

Professor Auxiliar