Dissertação
Differential regulatory response of Hodgkin’s Lymphoma according to PET result EVALUATED
O linfoma de Hodgkin é um tipo de linfoma, um cancro do sistema linfático. Apesar dos avanços em quimioterapia multi-agente nos últimos anos, até 10% dos casos de linfoma de Hodgkin são refratários e, depois de entrada em remissão, os pacientes sofrem um risco elevado de morte por várias causas. Estas complicações são dependentes do tratamento prescrito, e por isso mesmo, um aumento na precisão do prognóstico pode ajudar a melhorar estes resultados. Tomografia por Emissão de Positrões usando fluorodeoxyglucose (FDG-PET) intermédia é o principal indicador de resposta ao tratamento, no entanto, é intrusivo e caro. Neste contexto, apresentamos uma metodologia capaz de prever o resultado de uma FDG-PET intermédia após dois ciclos de quimioterapia Adriamycin, Bleomycin, Vinblastine e Dacarbazine (ABVD), através da análise de perfis de expressão de genes usando algoritmos estado da arte de aprendizam automática. Adicionalmente, propomos uma transformação dos dados para mapear o espaço dos dados original para um mais discriminativo através de biclustering. Esta metodologia produz resultados superiores aos obtidos anteriormente nestes dados. Um estudo adicional das relações regulatórias entre genes é levada a cabo para obter novo conhecimento acerca dos mecanismos moleculares associados com o linfoma de Hodgkin e discriminação da resposta ao tratamento. A abordagem apresentada é especialmente relevante devido à baixa incidência deste cancro, o que resulta numa falta de trabalhos que tirem proveito de ferramentas de aprendizagem automática e de tecnologias de sequenciamento de grande escala cada vez mais económicas e rápidas.
julho 16, 2021, 13:0
Publicação
Obra sujeita a Direitos de Autor
Orientação
ORIENTADOR
Rui Miguel Carrasqueiro Henriques
Departamento de Engenharia Informática (DEI)
Professor Auxiliar
