Dissertação

A framework for bacterial evolution simulation EVALUATED

Compreender a evolução de bactérias é um desafio de há muito. Esta área tem uma importante relevância clínica, dado que o conhecimento de como as bactérias evoluem e se adaptam pode ser usado para determinar como é que elas ganham resistências aos medicamentos antimicrobianos e como mudam a sua patogenicidade e desenvolvem virulência. Na natureza, a propagação e evolução de bactérias é condicionada pela interacção entre o patogénio e o hospedeiro. Além disso, o sistema imunitário do hospedeiro e a rede de contactos entre os hospedeiros criam as condições únicas em que uma determinada estirpe bacteriana podem aparecer e sobreviver. Não são apenas as barreiras geográficas ou físicas a limitar a rede de contactos, mas também os comportamentos sociais. Embora os modelos de evolução bacteriana existentes permitam a inclusão dos fenómenos de mutação e de recombinação como as forças principais que moldam o genoma, estes são geralmente utilizados de um modo simplista. A maior parte dos estudos recentes assume uma população homogénea que pode contactar entre si com uma mistura homogénea de indivíduos dentro de cada população. Além disso, a escala que normalmente é usada em simulações de populações de bactérias ainda é pequena comparativamente a casos reais. O objectivo deste trabalho é melhorar os modelos de evolução actual, incorporando dados de comportamento social, nomeadamente de redes sociais online ou MMORPGs (Massive Multiplayer Online Roleplaying Games). Para tal, foi desenvolvido um novo sistema escalável de simulação. Os resultados obtidos são de valor inestimável para compreender várias questões clinicamente relevantes.
Evolução de bactérias, Redes sociais, Modelos epidémicos, Redes de contactos sem escala, Algoritmos de simulação

novembro 7, 2012, 10:30

Documentos da dissertação ainda não disponíveis publicamente

Orientação

CO-ORIENTADOR

João André Nogueira Custódio Carriço

Universidade de Lisboa - Faculdade de Medicina

Investigador Principal

ORIENTADOR

Alexandre Paulo Lourenço Francisco

Departamento de Engenharia Informática (DEI)

Professor Auxiliar