Disciplina Curricular
Biologia Computacional BC
Mestrado Integrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores - MEEC 2006
Contextos
Grupo: MEEC 2006 > 2º Ciclo > Área de Especialização > Área de Especialização Secundária > Biologia Computacional
Período:
Peso
6.0 (para cálculo da média)
Objectivos
A Biologia Computacional (ou Bioinformática) desenvolve métodos computacionais e algoritmos para o processamento de dados biológicos e utiliza modelação matemática e estatística para definir hipóteses testáveis sobre entidades e processos biológicos. Esta disciplina introdutória pretende familiarizar os alunos com as metodologias computacionais e matemáticas que estão na base de muitas das abordagens que suportam os novos desenvolvimentos desta área. Adicionalmente, pretende-se desenvolver o espírito crítico através da leitura e análise de publicações cientificas relevantes à disciplina. A componente prática da disciplina pretende dotar os alunos da capacidade de desenvolvimento de ferramentas de software para o tratamento e integração de dados biológicos e clínicos.
Programa
Conceitos básicos de algoritmos Conceitos básicos de biologia molecular Grafos e genética Análise de sequências de DNA Algoritmos para alinhamento simples Algoritmos para alinhamento múltiplo Algoritmos para pesquisa de motivos Algoritmos para re-sequenciação Modelos probabilísticos: Modelos de Markov e HMMs Análise da expressão genética Algoritmos de Clustering e Biclustering Métodos para análise de filogenia Classificação usando árvores de decisão Métodos Bayesianos Análise de dados integrativa Seminário
Metodologia de avaliação
Avaliação contínua: • 5 Trabalhos de laboratório, com avaliação no laboratório (20%) • 2 testes (80%) Tem 1 exame ou teste de repescagem.