Dissertação

Fitness Comparison in Human Cells: A Transcriptome Analysis Approach EVALUATED

As interacções competitivas entre células constituem a base de vários processos em organismos multicelulares, não só de desenvolvimento como também homeostáticos. Estes mecanismos têm um papel essencial no controlo de qualidade dos tecidos, influenciando os processos de regeneração, envelhecimento, desenvolvimento e, conforme o contexto, podem tomar ainda um papel supressor ou promotor sobre o cancro. Um mecanismo de comunicação entre células durante a competição foi proposto, sendo baseado em uma proteína transmembranar chamada Flower, cujas isoformas constituem o "Flower Code". Estas "Fitness Fingerprints" permitem que as células comparem entre si as suas diferenças relativas de aptitude. Células menos aptas expressam isoformas que comunicam um estado "lose" enquanto células mais aptas expressam isoformas "win", permitindo assim a comparação relativa de fitness e a eliminação de células subóptimas. Este processo foi inicialmente descrito em Drosophila, tendo já sido identificados alguns componentes chave deste fenómeno. Contudo, muito continua por explorar em termos de mecanismos moleculares. O homólogo humano de flower foi identificado recentemente e as suas isoformas foram descritas, tendo sido demonstrado que estas conseguem também induzir o mecanismo de competição. Porém, principalmente no modelo humano muito continua por caracterizar. Para desvendar estes mecanismos, uma estratégia de análise transcriptómica foi escolhida com o intuito de identificar novos genes relevantes relacionados com a competição celular em humanos dependente de "Fitness Fingerprints". Para no futuro possibilitar mais estudos sobre estes mecanismos, um ensaio de competição com células humanas dependente de Flower foi avançado.
Competição celular, Fitness Fingerprints, Transcriptómica, RNA-seq, Expressão génica

Novembro 30, 2017, 14:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Eduardo Moreno Lampaya

Fundação Champalimaud

Doutor

ORIENTADOR

Maria Margarida Fonseca Rodrigues Diogo

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Auxiliar