Dissertação

Machine Learning methods for finding predictors of Rheumatoid Arthritis treatment response EVALUATED

A artrite reumatóide (AR) é uma doença autoimune caracterizada por uma resposta inflamatória crónica provocando inicialmente lesões nas articulações e podendo levar à perda da sua função. A incerteza da sua causa e a heterogeneidade dos pacientes dificultam o processo terapêutico. A combinação de medicamentos biológicos modificadores de AR, nomeadamente inibidores do fator de necrose tumoral (anti-TNF) com metotrexato constitui uma abordagem terapêutica comum. Porém, a dificuldade em prever o tipo de resposta do paciente à medicação constitui um grande obstáculo, dado que no eventual caso desta funcionar, os seus efeitos são apenas sentidos meses após o início da administração, o que leva a uma evolução dos sintomas e acarreta custos financeiros. A identificação de biomarcadores tem sido um tema incansável que, com base em métodos de aprendizagem automática, visa compreender os mecanismos desencadeadores da AR e alcançar a melhor terapêutica, que no limite constitui a "medicina de precisão". Esta tese envolveu a análise de dados transcriptómicos de pacientes com AR em instâncias diferentes de tratamento com anti-TNF. Regressão logística esparsa permitiu a seleção das características relevantes. Redes Bayesianas identificaram duas interações entre proteínas (MPO-CTSG e CTSG-AZU1) indicadoras da eficácia do tratamento e sabidas relevantes na comunidade científica. e os seus desempenhos comparados a nível de esparsidade, influência das funções de normalização/transformação e tipo de algoritmo. A regressão logística esparsa aliada à análise Bayesiana permitiu identificar biomarcadores com potencial clínico.
Artrite reumatóide, Biomarcador, Modelos esparsos, Previsão de resposta, Rede Bayesiana.

Janeiro 29, 2021, 14:0

Documentos da dissertação ainda não disponíveis publicamente

Orientação

ORIENTADOR

Alexandra Sofia Martins de Carvalho

Departamento de Engenharia Electrotécnica e de Computadores (DEEC)

Professor Auxiliar

ORIENTADOR

Susana de Almeida Mendes Vinga Martins

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Associado