Dissertação

Biological quantification of proteins in heterogeneous cell populations EVALUATED

Diferentes combinações de expressão de caderinas resultam em diferentes prognósticos em certos casos de cancro. A expressão de ambas, E-caderina e P-caderina, aumentam a mobilidade e proliferação celular enquanto a expressão apenas da E-caderina é sinonimo de diminuição da mobilidade. Um fármaco, dasatinib, pode ser administrado para suprimir os efeitos da expressão de P-caderina e assim alterar o comportamento celular para o expectável quando apenas E-caderina é expressa. Este comportamento pode ser estudado pela expressão da molécula p-120, uma proteína responsável por estabilizar o complexo de adesão entre caderinas e cateninas. Heterogeneidade em populações celulares relativamente a tamanho e morfologia celular são factores que podem deturpar características celulares específicas. Neste projecto, um algoritmo unificado para ruído Gaussiano e de Poisson é proposto para lidar com a variabilidade celular. Este algoritmo é aplicado para estudar variações de expressão da proteína p-120 em diferentes culturas celulares. Analisar características, como a localização dos picos e os máximos de expressão, permitiu a caracterização da expressão da molácula p-120. Pode-se observar que esta diminui quando ambas E-caderina e P-caderina estão presentes comparativamente à existência unicamente de E-caderina. Quando a dasatinib é administrada, a expressão de p-120 aumenta recuperando o comportamento celular. Diferenças na compensação geométrica utilizando ruído Gaussiano ou Poisson são também analisadas para reiterar a natureza do ruído de Poisson em imagens de Imunofluorescência. Dada a irrelevância da morfologia celular para os padrões de expressão de proteínas, o algoritmo provou ser eficaz na compensação geométrica e cálculo de perfis representativos de cada população celular.
Compensação Geométrica, Perfis Celulares, Expressão Proteica, Imagens de Fluorescência, Quantificação Biológica, Caderinas.

Outubro 16, 2015, 14:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Maria Raquel Campos Seruca

IPATIMUP

Doutora

ORIENTADOR

João Miguel Raposo Sanches

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Auxiliar