Dissertação

The relationship between the speed of spread of HIV in the population and the virus evolutionary rate EVALUATED

Atualmente a infecção por VIH-1 apresenta-se como uma doença crónica, contrastando com um passado próximo onde esta infecção era letal. O VIH-1 é um vírus que evolui relativamente rápido e com facilidade, o que se reflete na maneira como contorna os mecanismos de defesa do sistema imunitário do hospedeiro. São muitos os factores que influenciam o contorno que uma epidemia toma e para aferir a relação entre velocidade de propagação da infecção e a taxa evolucionária do vírus recorreu-se a um modelo de simulação matemática por agentes. A evolução intra-hospedeira foi integrada no modelo por forma de distância genética e assim se poder relacionar a sua variação com a velocidade de crescimento de uma epidemia. Foram gerados diferentes cenários de simulação considerando diferentes fases de transmissões (apenas aguda, apenas crónica e ambas). Obteve-se validação do modelo com os dados da epidemia da Letónia (1987-2010). A análise dos resultados sugere a existência de uma relação inversa entre as quantidades descritas. Verificou-se ainda que a velocidade de crescimento da epidemia está relacionada com a existência de \textit{super-spreaders} e as epidemias são sustidas devido a uma maior fracção de infecções ocorrerem ainda na fase aguda, no entanto, transmissões agudas apenas por si muito dificilmente geram epidemias consideráveis. Por último, elevadas taxas evolucionárias estão associadas a períodos mais prolongados do vírus no agente infeccioso antes de acontecer a transmissão.
Epidemiologia, Divergência de VIH-1, Modelo por agentes, Simulação estocástica, Abstração populacional

Novembro 21, 2019, 15:30

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Susana de Almeida Mendes Vinga Martins

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Associado

ORIENTADOR

Ruy Miguel Sousa Soeiro de Figueiredo Ribeiro

Faculdade de Medicina da Universidade de Lisboa

Professor Associado