Dissertação

Phage-Host Relationships in the Vulture Gut Microbiome EVALUATED

Os abutres desempenham um papel fundamental nos ecossistemas devido à sua dieta baseada em carne putrefacta. Consequentemente, aparentam ser resistentes a agentes patogénicos provenientes dessa carne. Possuindo provavelmete uma comunidade microbiana tolerante a esses agentes. Avanços na tecnologia de sequenciação de DNA fornecem novas ferramentas que permitiem estudar a dinâmica de comunidades microbianas. Os bacteriofagos são vírus capazes de atacar bactérias específicas e, em alguns casos, de lisar essas células bacterianas. Devido à acção dos fagos e das suas interaccções com bactérias, eles são capazes de modular comunidades microbianas. Para caracterizar a comunidade microbiana do intestino de abutres, extraiu-se de uma amostra fecal o DNA total de bactérias e de bacteriofagos, tendo-se de seguida sequenciado o gene que codifica para o rRNA 16S bacteriano e o genoma de fagos. Além disso, foram isoladas colónias puras de bactérias e fagos para estudo das interacções fago-hospedeiro através de ensaios de placas de lise, também executadas com Escherichia coli e Salmonella senftenberg, conhecidas como agentes patogénicos. Durante este ensaio foram encontradas placas de lise para um fago de entereobactéria ainda não descrito. Em conclusão, a partir de fezes de abutre, caracterizou-se o viruloma e o metagenoma, sendo este rico em Clostridia e Fusobacteria. Contudo as bases de dados são muito incompletas não foi permitida a identificação da totalidade do metagenoma em estudo. Ensaios de placas são um método fácil para estudar interacções entre fagos e bactérias, mas a maioria das bactérias não são cultiváveis sendo necessário optimizar ferramentas para o seu cultivo.
microbioma intestinal, abutre, viruloma, metagenoma, interacçes fago e hospedeiro, terapia fágica

Novembro 20, 2015, 14:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Leonilde de Fátima Morais Moreira

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Auxiliar

ORIENTADOR

Dennis Sandris Nielsen

University of Copenhagen

Professor Associado