Dissertação

Towards the identification of biomarker-genes for the diagnosis of invasive candidemia caused by Candida glabrata EVALUATED

A incidência de infecções sistémicas causadas pela C. glabrata, um fungo patogénico oportunista, tem aumentado ao longo dos anos, contribuindo para um aumento da mortalidade e mobilidade de populações em risco. Os métodos actualmente usados no diagnóstico de candidiase sistémica baseiam-se na cultura de amostras recolhidas do doente, em particular amostras de sangue. Contudo estes métodos apresentam baixa sensibilidade, particularmente nos estádios iniciais de infecção em que a carga fúngica é baixa. Consequentemente ocorrem atrasos no inicio da terapia fúngica estando isto associado a um aumento da taxa de mortalidade dos pacientes Para além disto, o diagnóstico é também dificultado pelo facto da C. glabrata ser um comensal comum do Homem, tornando-se difícil avaliar o potencial patogénico das estirpes isoladas. Neste projecto tentou identificar-se um conjunto de genes que possam servir como biomarcadores para a detecção de candidiasis invasiva causada por C. glabrata. Partindo da análise de transcriptomas de um conjunto de isolados comensais e invasivos recorreu-se ao uso de várias abordagens bioinformáticas supervisionadas e não-supervisionadas, identificando 24 genes como sendo aqueles que têm um maior potencial para discriminar os isolados comensais dos invasivos. Além disso, um grande número de genes que não foram até agora associados à virulência de C. glabrata, foram identificados como sendo diferencialmente expressos em isolados comensais e invasivos. Espera-se que os resultados gerados possam contribuir não só para acelerar o desenvolvimento de ferramentas de diagnóstico molecular de candidiase como também para uma melhor compreensão dos mecanismos subjacentes à transição comensal-patogénico em C. glabrata
Candidiasis sistémica, C.glabrata, diagnósticos moleculares, ferramentas-diagnostico-microarray

Julho 6, 2015, 11:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Sara Alexandra Cordeiro Madeira

Departamento de Engenharia Informática (DEI)

Professor Auxiliar

ORIENTADOR

Nuno Gonçalo Pereira Mira

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Auxiliar