As Áreas de Especialização são realizadas no 1.º semestre do 2.º ano. Cada Área corresponde a 18 ECTS, sendo 6 ECTS da Unidade Curricular (UC) obrigatória e 12 ECTS de duas UC opcionais. O elenco de UC de cada Área de Especialização é apresentado abaixo.

ENERGIA E ALTERAÇÕES CLIMÁTICAS
Gestão da Qualidade do Ar e Alterações Climáticas (obrigatória)
Gestão de Sistemas de Energia
Biocombustíveis
Armazenamento de Energia

GESTÃO E TECNOLOGIAS DA ÁGUA
Instalações de Tratamento (obrigatória)
Poluição e Protecção de Águas Subterrâneas
Drenagem Urbana e Controlo da Poluição
Soluções Baseadas na Natureza no Ciclo Urbano da Água
Gestão Integrada de Bacias Hidrográficas

GESTÃO AMBIENTAL
Sistemas de Gestão Ambiental (obrigatória)
Ecologia Industrial
Avaliação Ambiental Estratégica
Gestão da Qualidade do Ar e Alterações Climáticas

ORDENAMENTO DO TERRITÓRIO
Planeamento Biofísico e Ordenamento do Território (obrigatória)
Soluções Baseadas na Natureza no Ciclo Urbano da Água
Avaliação Ambiental Estratégica
Gestão Integrada de Bacias Hidrográficas