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Dissertação

Evolution and Bioinformatics Analysis of the Drug:H+ Antiporter Family 1 (DHA1) in the hemiascomycete yeasts EVALUATED

Detalhes: Os genes do organismo Saccharomyces cerevisiae, da família 1(DHA1) e família 2(DHA2) de antiportadores de drogas, e da superfamília de facilitadores, estão envolvidos na resistência a múltiplas drogas/xenobióticos. O objetivo deste trabalho foi reconstruir e caracterizar a evolução dos genes DHA1, codificados no genoma de 33 estirpes de Hemiascomycetos classificadas na família taxonómica Saccharomycetaceae (correspondendo ao total de 29 espécies). Paralelamente, foram identificadas e analisadas, de forma breve, as proteínas DHA1 e DAG codificadas no genoma de 61 estirpes adicionais que estão classificadas em mais de 15 famílias de Hemiascomycetos. A constrição e atravessamento de uma rede de similaridade de pares blastp entre mais de um milhão de ORF’s em Hemiascomycetos, permitiu identificar 1382 transportadores DHA1 não fragmentados (após a correção das ORF’s problemáticas). Assim, foi reconstruída a historia evolutiva dos genes DHA1, codificados no genoma das 33 estirpes Saccharomycetaceae, com recurso á combinação de técnicas de filogenia e de vizinhança de genes. Isto permitiu identificar 26 grupos filogenéticos de genes DHA1, e fazer uma revisão e ampliação de 9 linhagens de genes DHA1 publicadas em estudos anteriores. As metodologias do estado de arte sobre filogenia, genómica comparativa, evolução proteica foram utilizadas para expandir o conhecimento acerca destes transportadores DHA1, ainda pouco caracterizados bioquimicamente, permitindo obter novas conclusões sobre o envolvimento da diversificação funcional destas proteínas com os eventos genómicos ancestrais , da duplicação total do genoma ,duplicações locais e perdas de genes, transferências horizontais de genes entre espécies de leveduras, rearranjos cromossômicos, e outros fenômenos de remodelação genómica.
Keywords: DHA1, DAG, Saccharomyces cerevisiae, Resistência a Múltiplas drogas, Saccharomycetaceae, Duplicação total do genoma

Discussão: julho 4, 2016, 15:0