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Dissertação

Development of the PathoYeastract database: aiming the study of transcriptional regulation in pathogenic yeasts EVALUATED

Detalhes: A base de dados PathoYeastract (PATHOgenic YEAst Search for Transcriptional Regulators And Consensus Tracking - www.pathoyeastract.org) é uma ferramenta para a análise e previsão de associações de regulação transcricional, ao nível do gene e do genoma, em leveduras patogénicas. Na sua versão actual, inclui informação focada nas duas espécies mais prevalentes de leveduras patogénicas do género Candida: C. albicans e C. glabrata. Esta tese de mestrado é uma contribuição para a construção da PathoYeastract. Inclui o desenvolvimento de scripts para a recuperação automática de dados para cada gene de C. albicans e C. glabrata, conforme encontrados na base de dados Candida Genome Database, incluindo sequências codificante e promotora, descrição, termos da Gene Ontology a ele associados e ortólogos em Saccharomyces cerevisiae e noutras espécies de Candida. Dada a falta de dados experimentais, a base de dados foi desenvolvida para prever associações de regulação com base na regulação transcricional de factores de transcrição e genes alvo ortólogos na levedura modelo Saccharomyces cerevisiae. Com a ajuda desta ferramenta, é expectável que a comparação entre espécies possa trazer luz aos mecanismos subjacentes à evolução das redes de regulação transcricional entre leveduras aparentadas. A incorporação de dados de regulação relativas a outras espécies próximas do género Candida, que alargará o espectro de acção desta base de dados ao estudo de redes de regulação em espécies diferentes, está prevista para o futuro próximo, com impacto espectável na compreensão do desenvolvimento da patogénese de da resistência a fármacos antifúngicos.
Keywords: Candida glabrata, Candida albicans, Associações regulatórias, PathoYeastract, Previsão de regulação transcricional, Redes de regulação transcricional

Discussão: julho 22, 2016, 14:0