Dissertação
Towards implementation of an itaconic acid biosensor for prospecting eukaryotic host producers EVALUATED
O ácido itacónico é um composto de valor acrescido, com uma procura de mercado em expansão. Recentemente, diversas estratégias têm sido desenvolvidas para a implementação da produção de ácido itacónico em diferentes espécies hospedeiros microbianos com diferentes taxas de sucesso. Contudo, a otimização deste processo é limitada pelo facto do ácido itacónico ser uma molécula inconspícua, sendo a sua deteção restrita a métodos analíticos, como HPLC. Neste contexto, os biosensores surgem como ferramentas úteis no screening e no design de estirpes super-produtoras. Já foi desenvolvido um biosensor bacteriano para ácido itacónico, o qual se baseia num fator de transcrição (itcR) de Yersinia pseudotuberculosis e de Pseudomonas aeruginosa e a sequência de DNA correspondente. Como tal, neste documento descreve-se a otimização do sistema de Yersinia através da modulação interação entre o ItcR e a sua sequência-alvo no promotor por estratégias de mutagénese dirigida e aleatória, e ainda os primeiros passos para a subsequente transferência deste sistema para hospedeiros eucariotas. Igualmente, é explorado o ItcR de Pseudomonas aeruginosa como potencial alternativa ao ItcR de Yersinia pseudotuberculosis. Finalmente, com vista a identificar homólogos do ItcR potencialmente interessantes para aplicações de biosensing noutras espécies bacterianas, é feita uma análise in sillico alargada para identificar ortólogos dos genes envolvidos na degradação do ácido itacónico em bactérias e fungos.
dezembro 9, 2019, 14:0
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Orientação
