Dissertação

Empowering Antibiotic Polymers Design through Coarse Grained Molecular Dynamics EVALUATED

Os traços de resistência aos antibióticos aparecem quando as bactérias são capazes de crescer na presença de concentrações terapêuticas de medicamentos antibióticos. O contínuo uso indevido desses medicamentos em conjunto com a falta de incentivos para o desenvolvimento de novos medicamentos pela indústria farmacêutica, impõe a necessidade de alternativas para conter a atual crise de antibióticos. O desenvolvimento de polímeros biomiméticos com base nas características de peptídeos de defesa do hospedeiro é um campo com muito potencial. Neste trabalho, um modelo coarse­grain Martini de uma nanopartícula terapêutica, que consiste de um núcleo de dendrímero de poliureia com cadeias acopladas de oligo(etilenimina), foi construído e testado contra modelos de membrana fosfolipídica para compreender quais os possíveis mecanismos que proporcionam a sua actividade antimicrobiana. Além disso, a partir de análises, três modificações nessa nanopartícula foram testadas com o objetivo de melhorar os resultados anteriores. Os resultados mostraram que quando a nanopartícula tem uma carga líquida positiva, ela apresenta a seletividade desejada em relação ao modelo de membrana aniônica, causando curvaturas negativas que podem induzir uma maior permeabilização e/ou rompimento. A inserção de uma das modificações aumentou o conteúdo hidrofóbico da nanopartícula e melhorou a distância entre a nanopartícula e o centro da membrana, sem perder a seletividade desejada. A capacidade de modificar a distribuição de íons do sistema pode ser um indicativo de um modo de ação diferente.
Antibióticos, Poli(etilenimina), Dendrímero de poliureia, Dinâmica Molecular, Membrana lipídica, Modelo Coarse­Grain Martini.

janeiro 27, 2021, 14:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Vasco Daniel Bigas Bonifácio

Departamento de Engenharia Química (DEQ)

Colaborador Docente

ORIENTADOR

Manuel Nuno de Sousa Pereira Simões de Melo

Universidade Nova de Lisboa – ITQB

Investigador Auxiliar