Dissertação

Super Resolution Imaging of Protein Aggregates in Cell Models EVALUATED

A doença de Parkinson é uma das mais comuns doenças neurodegenerativas no mundo. A agregação de proteínas é uma das possíveis causas que por essa razão leva o mesmo a ser estudado em diversos aspetos como a localização e interação com o meio que o rodeia. Usa-se a microscopia confocal e STED para que seja possível o estudo dos mecanismos que levam à doença. Neste trabalho, usámos células HEK-293T e H4 para reproduzir a resposta e os mecanismos envolvidos. Diversos agregados proteicos foram estudados para a criação de um detalhado método para uso nas diversas técnicas de microscopia. O método foi desenvolvido com vista a suplantar a falta do terceiro eixo, podendo assim obter o volume do agregado e a sua localização. Os resultados da análise revelam um método simples para a obtenção do volume de agregados proteicos nos modelos estudados (proteína Sinfilina-1(Sph1) marcada com EGFP, fragmento fluorescente de GFP – modelo de agregação Sph1GFP - a ⍺-sinucleína (⍺Syn com EPGFP fragmentado com apenas 83 aminoácidos) e proteína Sph1 marcada com o marcador V5 – modelo de agregação SynTWT+Sph1-). Existem ainda diferenças a serem notadas relativamente ao tipo de microscopia usado nomeadamente no volume dos agregados e número de agregados por célula. No modelo de agregação SynTWT+Sph1 parece demonstrar a colocalização entre as proteínas está desfasada no eixo Z.
⍺-sinucleína, Sinfilina-1, Microscopia de Super Resolução, Segmentação, Aprendizagem Profunda, Volume

junho 21, 2022, 17:0

Publicação

Obra sujeita a Direitos de Autor

Orientação

ORIENTADOR

Tiago Fleming Outeiro

Department of Neurodegeneration and Restaurative Research, University Medizin Gottingen, Gottingen, Germany

Professor Catedratico

ORIENTADOR

João Miguel Raposo Sanches

Departamento de Bioengenharia (DBE)

Professor Catedrático